A APM tem vindo a assinar protocolos com instituições de diferentes áreas e nacionalidades com o objetivo de trocar experiências e colaborar em iniciativas de interesse comum e, por vezes, também com o intuito de proporcionar aos seus associados condições preferenciais na aquisição de bens e serviços.
Neste momento estão ativos protocolos que visam sobretudo a implementação e desenvolvimento de formação, com as seguintes instituições:
Instituto de Educação da Universidade de Lisboa
Faculdade de Ciências da Universidade do Porto
Sociedade Portuguesa de Investigação em Educação Matemática (SPIEM)
Fundação PT (Plataforma Khan Academy)
Texas Instruments Portugal (Grupo T3)
Federación Española de Sociedades de Profesores de Matemáticas (FISEM)
Asociación Galega do Profesorado de Educación Matemática (AGAPEMA)
Diversos Centros de Formação de Associações de Escolas